De par ses caractéristiques exceptionnelles, la source souterraine de Port-Miou est une véritable source de connaissances scientifiques. Elle permet le suivi d’études scientifiques et l’acquisition de connaissances dans divers domaines, telle la géologie, la géophysique, la biologie ou la chimie. Le projet KarstEAU, mené de 2007 à 2013, en est un bon exemple : des chercheurs ont grâce à lui pu estimer les volumes d’eau souterraine exploitables à l’échelle régionale.
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